科学技術分野におけるEUと日本の協力は、 4つの主要な協定に基づいて実施されています。
まず、 2009年に署名、2011年3月20日に発効した包括的な科学技術協力協定です。
次に、2015年5月に締結された2つの重要な協定があります。 研究・イノベーションにおける一層緊密な関係を目指す 「共同ビジョン」 と 日・EU間の研究・イノベーションにおける新たな戦略的パートナーシップです。
最後に、 共通の利害・関心を有する課題について政治的・分野別の協力や連携を促進することで、全体的なパートナーシップを強化する日・EU戦略的パートナーシップ協定(SPA)です。