Los ejes principales de la cooperación de la Unión Europea en el Perú son los siguientes:

1. Inclusión social: apoyando la implementación de políticas públicas en materia de protección social de los más vulnerables
2. Innovación y competitividad: apoyando políticas públicas, universidades e iniciativas del sector privado que buscan crear nuevos fuentes de ingreso, diversificar la economía y profundizar las relaciones comerciales UE-Perú.
3. Educación superior: promoviendo alianzas entre instituciones educativas Peruanas y europeas a través del programa Erasmus +, que permite el intercambio de estudiantes, docentes y personal administrativo
4. El programa país de la OCDE (Organización para la Cooperación y el Desarrollo Económico) : trabajando junto con autoridades en la implementación de las reformas institucionales en el marco de la hoja de ruta de la OCDE
5. Democracia y derechos humanos: apoyando la implementación de reformas electorales (incluyendo las recomendaciones de la Misión de Observación Electoral de la UE en 2016) y los esfuerzos del sector público, sector privado y sociedad civil en materia de derechos humanos 
6. Seguridad, justicia y drogas: trabajando con autoridades públicas, sector privado y sociedad civil en la lucha contra las drogas y el crimen organizado.
7. Cambio climático: trabajando con entidades públicas y privadas en la implementación de las contribuciones nacionales en el marco de los acuerdos internacionales y apoyando iniciativas innovadoras que promueven la adaptación y mitigación de los efectos del cambio climático.

Estos ejes de trabajo se implementan a través de diferentes mecanismos  como proyectos de asistencia técnica, apoyo presupuestario, convocatorias a propuestas, becas y la promoción de espacios de coordinación nacional e internacional.

Cooperación con la Comunidad Andina

La Unión Europea y la Comunidad Andina vienen trabajando juntos desde inicio de los años 1970, cuando se iniciaron las relaciones entre ambos bloques.

Los ejes principales de la cooperación son:

• promoción de la cohesión social y económica en las regiones fronterizas en la CAN
• la lucha contra las drogas ilícitas a través de acciones de prevención y rehabilitación. 

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