L’Accord de Cotonou a intégré le dialogue politique avec les institutions nationales sur les enjeux d’intérêt commun. Le dialogue se traduit par des réunions formelles entre Chefs de mission de l'UE et membres du Gouvernement. De nombreuses rencontres à caractère plus ciblé en liens avec les questions de coopération ou des questions d'intérêt commun se tiennent aussi de façon régulière. Au titre de ce dialogue, l'UE tient également des sessions avec l'Assemblée nationale, la société civile et la classe politique.
Dans le cadre du dialogue politique, l'Union européenne a facilité les concertations entre la majorité présidentielle et l'opposition en 2006-2007 et accompagné le processus démocratique en 2011. L'accompagnement des acteurs politiques tchadiens par l'UE a été à la base de la réforme législative et de la mise en place d'une administration électorale.