La Délégation assure la Présidence de l’Union européenne au Gabon et travaille en étroite collaboration avec les États membres de l’UE qui y sont accrédités (Allemagne, Espagne, France et Italie). Elle collabore également avec les missions présentes à Sao Tomé-et-Príncipe (Portugal).
Ses trois fonctions principales :
- Assurer le suivi des relations bilatérales avec les trois pays dans les domaines des relations politiques, économiques, commerciales et coopération.
- Assurer le suivi des politiques de l'UE dans tous les secteurs.
- Promouvoir et défendre les valeurs et intérêts de l'UE.
Bien qu'elle ait le statut de mission diplomatique, la Délégation ne traite pas des tâches à caractère consulaire (l’émission des visas notamment), qui sont traitées par les Ambassades des États membres de l'UE) mais fonctionne comme canal officiel pour des relations bilatérales politiques, de développement économique, commercial entre l’UE et les pays pour lesquels elle est accréditée.