La Comisión Europea implementa globalmente programas de cooperación, por una parte a nivel bilateral definidos en Multianual Indicative Plans (MIPs) en acuerdo con los países socios con quienes cooperamos, pero también a través de programas que tienen un alcance global y son complementarios a los anteriores y  la cooperación prestada a través de organismos multilaterales y regionales, como es el caso de la cooperación con Colombia y la Comunidad Andina.

Desde hace más de 20 años, la cooperación de la Unión Europea hacia Colombia se ha orientado a apoyar el país en su esfuerzo por impulsar un desarrollo económico y social más integrador, reducir la pobreza y la inequidad, incrementar el acceso a los servicios sociales, aumentar la cohesión social, abordar las cuestiones de gobernanza y fortalecer las instituciones. La existencia de un conflicto armado prolongado y arraigado ha requerido además apoyar los esfuerzos de Colombia para mitigar las consecuencias del acceso restringido a partes del territorio, así como reducir las brechas de desarrollo entre las regiones, y entre estas y las zonas urbanas.

Varios instrumentos de cooperación se utilizan actualmente de forma complementaria para fomentar el desarrollo territorial sostenible y contribuir al alcance de una paz duradera:

1. Cooperación bilateral: varios programas del programa bilateral 2007-2013 siguen implementándose tal y como el apoyo institucional al sistema penal colombiano (8.9 M EUR), el fortalecimiento de la capacidad institucional para incrementar la integridad y la transparencia (9.02 M EUR), el apoyo presupuestario a la política de desarrollo rural (37.7 M EUR) y a la política nacional de competitividad y productividad del sector Lácteo  (20.4 M EUR). El programa de apoyo al fortalecimiento de la acción contra minas en Colombia (7.2 M EUR) terminó a finales de 2016 En el marco de la cooperación bilateral 2014-2017 que busca consolidar los resultados alcanzados por el apoyo técnico y financiero europeo hasta hoy, 67 millones de euros están actualmente empleados para fomentar por ejemplo el desarrollo local sostenible (20.8 M EUR), apoyar la estrategia de competitividad regional (31.8 M EUR) y fortalecer las capacidades locales para la construcción de desarrollo y paz en Colombia (FORPAZ – 11 M EUR). 
2. Instrumentos temáticos que apoyan el empoderamiento y fortalecimiento de la sociedad civil colombiana (más de 6 M EUR anuales) y de las autoridades locales (1.5 M EUR anualmente), la promoción y defensa de los derechos humanos y de la democracia (1 M EUR anual), y la promoción de los bienes públicos globales (procesos de convocatorias competitivas globales)
3. Apoyo a la Estrategia de Respuesta Rápida del Gobierno en el contexto del posconflicto mediante el Instrumento para la Estabilidad y Paz (IcSP) (más de 27 M EUR para el periodo 2015-2017)
4. El fondo fiduciario europeo para la Paz en Colombia: este fondo, aprobado en Diciembre de 2016, reúne contribuciones de 14 Estados Miembros de la Unión Europea totalizando más de 95 M EUR para apoyar la estrategia colombiana para el postconflicto, sobre todo en el ámbito del desarrollo rural integral con enfoque territorial.
5. Programas regionales y globales: Colombia beneficia de los programas de cooperación regional que abarcan a los 18 países de  la región de América Latina en materia de seguridad y drogas, gobernanza y equidad social, sostenibilidad ambiental y cambio climático y programas globales enfocados al fomento de intercambios y cooperación entre universidades, profesores, estudiantes, institutos de investigación e  investigadores europeos, colombianos y de otras regiones.
6. Ayuda humanitaria: más de 10 M EUR anuales están destinados a reducir los sufrimientos humanos y apoyar el número muy elevado de personas desplazadas en todo el país.

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