Grâce à sa relation particulière avec la France, Monaco participe directement à certaines politiques de la Communauté. Monaco fait partie intégrante du territoire douanier de la Communauté (article 3, paragraphe 2, point b), du code des douanes) et applique directement la plupart des mesures relatives à la taxe sur la valeur ajoutée (TVA) et aux droits d'accises, en particulier celles concernant la libre circulation des marchandises dans la Communauté. Toutefois, sa participation au territoire douanier de la Communauté ne s'étend pas au domaine du commerce extérieur. Les accords commerciaux préférentiels conclus par la Communauté ne s'appliquent qu'aux marchandises originaires du territoire de la Communauté. Les marchandises produites à Monaco ne peuvent pas être considérées comme était originaires de la Communauté et ne sont généralement pas incluses dans l'application étendue du protocole concernant la définition des "produits originaires" établie avec les partenaires commerciaux de la Communauté.

Par l'intermédiaire de la France, Monaco est également intégré à l'espace Schengen (voir la décision du comité exécutif du 23.6.1998).

En vue de l'introduction de l'euro, le Conseil des ministres de l'UE a autorisé la France à négocier une nouvelle convention monétaire avec Monaco. Celle-ci permet notamment à la Principauté d'utiliser l'euro comme monnaie officielle, d'accorder un statut juridique aux pièces et billets en euros et de frapper une quantité limitée de pièces d'euros avec sa propre face nationale. Les annexes de la convention ont été actualisées en 2006.

La Communauté a conclu avec Monaco un accord concernant l'application de la législation communautaire aux médicaments, aux produits cosmétiques et aux dispositifs médicaux qui est entré en vigueur le 1er mai 2004. Cet accord prévoit l'application des dispositions législatives communautaires pertinentes à Monaco. Toutefois, les marchandises produites à Monaco ne sont pas considérées comme étant originaires de la Communauté.

La Commission a par ailleurs conclu avec Monaco un accord en matière de fiscalité des revenus de l'épargne (en vigueur depuis le 1er janvier 2005).